MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	CTA	3	9	1473	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009004	TAT	2	6	1486	1491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009004	TGTC	2	8	2709	2716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009004	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009004	GAA	2	6	9700	9705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009004	GGT	2	6	10562	10567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009004	TGA	2	6	10613	10618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009004	TGT	2	6	10626	10631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009004	ATT	2	6	10687	10692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009004	TAAT	2	8	10726	10733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009004	AAATG	2	10	11880	11889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009004	CAAA	2	8	11939	11946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009004	A	7	7	11944	11950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009004	AAGG	2	8	11972	11979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009004	A	7	7	12389	12395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009004	AAG	2	6	12464	12469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009004	TAA	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009004	A	9	9	12517	12525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009004	TGA	2	6	12526	12531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009004	ATT	2	6	12537	12542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009004	A	6	6	12595	12600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009004	ATAG	2	8	13732	13739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009004	T	8	8	13775	13782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009004	CTC	2	6	13784	13789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009004	TAAA	2	8	13794	13801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009004	TAA	2	6	13809	13814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009004	T	6	6	18555	18560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009004	T	6	6	18589	18594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009004	CTG	2	6	18707	18712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009004	TAAA	2	8	18742	18749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009004	ATA	2	6	18775	18780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009004	TAT	3	9	18807	18815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009004	CAAA	2	8	18831	18838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009004	ATC	2	6	19134	19139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009004	TCT	2	6	19893	19898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009004	ATT	2	6	19902	19907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009004	ACA	2	6	19969	19974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009004	ATT	2	6	19978	19983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009004	GAAT	2	8	19989	19996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009004	A	6	6	23180	23185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009004	TACT	2	8	23197	23204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009004	TTA	2	6	23269	23274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009004	AAG	2	6	23286	23291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009004	TAA	3	9	23309	23317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009004	T	8	8	25439	25446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009004	AAT	2	6	25456	25461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009004	A	6	6	25482	25487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009004	TAT	2	6	25488	25493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009004	GAC	2	6	25523	25528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009004	TTA	2	6	25537	25542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009004	AT	3	6	25551	25556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009004	A	7	7	25590	25596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009004	ATA	2	6	25608	25613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009004	CAA	2	6	25637	25642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009004	CGG	2	6	25685	25690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009004	GGA	2	6	25725	25730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009004	GCGT	2	8	25784	25791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009004	TCC	2	6	25808	25813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009004	AGC	2	6	25835	25840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009004	TCG	2	6	25849	25854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009004	CGG	2	6	25951	25956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009004	CTTAA	2	10	26057	26066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009004	AAGTC	2	10	26198	26207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009004	GTA	2	6	26289	26294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009004	ATG	2	6	26312	26317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009004	T	7	7	26368	26374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009004	TAA	2	6	26391	26396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009004	CCT	2	6	26406	26411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009004	TTTA	2	8	26426	26433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009004	TATAA	2	10	26453	26462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009004	CAAAA	2	10	28357	28366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009004	GT	3	6	30321	30326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009004	GAA	2	6	30350	30355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009004	A	7	7	30801	30807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009004	T	6	6	30828	30833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009004	ACC	2	6	30840	30845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009004	AGA	2	6	30886	30891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009004	TAAA	2	8	30915	30922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009004	AGTA	2	8	30928	30935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009004	A	8	8	32161	32168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009004	TTA	2	6	32180	32185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009004	T	7	7	32227	32233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009004	CGAA	2	8	32291	32298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009004	GGA	2	6	32360	32365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009004	T	7	7	32387	32393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009004	CAG	2	6	32400	32405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009004	AAG	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009004	CCA	2	6	32460	32465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009004	TAA	2	6	32492	32497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009004	TAA	2	6	32504	32509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009004	A	7	7	32508	32514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009004	T	6	6	32562	32567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009004	T	6	6	32578	32583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009004	TAA	2	6	32593	32598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009004	T	6	6	32635	32640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009004	AT	3	6	32653	32658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009004	T	7	7	32658	32664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009004	AT	4	8	32665	32672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009004	A	7	7	32679	32685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009004	T	7	7	32711	32717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009004	C	7	7	32757	32763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_009004	TA	3	6	32764	32769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009004	TG	4	8	32810	32817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009004	G	6	6	32837	32842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009004	A	6	6	32852	32857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009004	TAA	2	6	32898	32903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009004	ATCA	2	8	32909	32916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009004	T	7	7	32945	32951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009004	TAA	3	9	32958	32966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009004	TCC	2	6	33305	33310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009004	A	6	6	33315	33320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009004	TAT	2	6	33353	33358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009004	TAT	2	6	33391	33396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009004	CCT	2	6	33785	33790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009004	CAA	2	6	34195	34200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009004	T	6	6	34210	34215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009004	T	6	6	34303	34308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009004	GTA	2	6	35030	35035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009004	GTA	2	6	35040	35045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009004	ACA	2	6	35055	35060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009004	T	6	6	35094	35099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009004	TAA	2	6	38507	38512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009004	TGCCT	2	10	38517	38526	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009004	T	7	7	39557	39563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009004	TAG	2	6	39774	39779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009004	ATA	2	6	39792	39797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009004	TAAA	2	8	39808	39815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009004	TAAG	2	8	40167	40174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009004	T	6	6	40192	40197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009004	CCT	2	6	40217	40222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009004	TTTAA	2	10	40238	40247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009004	CTGC	2	8	40447	40454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009004	GTTA	2	8	40487	40494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009004	A	7	7	40507	40513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009004	TAA	2	6	40795	40800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009004	T	6	6	40807	40812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009004	AGT	2	6	40830	40835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009004	GAT	2	6	41288	41293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009004	A	6	6	41294	41299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009004	GAA	2	6	41875	41880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009004	A	6	6	41879	41884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009004	A	6	6	41886	41891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009004	TGT	2	6	41906	41911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009004	TTG	2	6	42226	42231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009004	CA	4	8	42242	42249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009004	AGG	2	6	42270	42275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009004	TA	3	6	42496	42501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009004	TAT	2	6	42614	42619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009004	TAA	2	6	42679	42684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009004	TGAC	2	8	42688	42695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009004	AT	3	6	42698	42703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009004	ATA	2	6	42737	42742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009004	TAA	2	6	42759	42764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009004	A	6	6	42763	42768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009004	TCATT	2	10	42860	42869	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009004	GTA	2	6	42877	42882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009004	AT	3	6	42909	42914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009004	CTTT	2	8	42964	42971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_009004	A	6	6	44430	44435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009004	TAAA	2	8	44452	44459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009004	ATGA	2	8	44482	44489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009004	A	8	8	44734	44741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009004	TAA	2	6	44807	44812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009004	TTG	2	6	44866	44871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009004	GTCA	2	8	44886	44893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_009004	GAT	2	6	44952	44957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009004	AAAAT	2	10	45004	45013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009004	TAA	2	6	45020	45025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009004	AT	3	6	45141	45146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009004	T	6	6	45146	45151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009004	CAAAA	2	10	45158	45167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_009004	TA	3	6	45472	45477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009004	AT	4	8	45479	45486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_009004	TTTGA	2	10	45499	45508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009004	ACA	2	6	45531	45536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_009004	TTTTG	2	10	45982	45991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_009004	TGT	2	6	46211	46216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009004	GTT	3	9	46276	46284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009004	GGA	2	6	46315	46320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009004	T	6	6	46337	46342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009004	TAT	2	6	46364	46369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009004	AGAA	2	8	46372	46379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009004	CAA	2	6	48478	48483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_009004	TAT	2	6	48553	48558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009004	T	6	6	48905	48910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009004	AAT	2	6	48919	48924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009004	AAT	2	6	49000	49005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009004	ATAAA	2	10	49043	49052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_009004	A	7	7	49072	49078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_009004	TAA	2	6	49084	49089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_009004	A	7	7	49159	49165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_009004	AATA	2	8	49224	49231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009004	ACA	2	6	49238	49243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_009004	T	6	6	49325	49330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_009004	TAA	2	6	49362	49367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_009004	GTT	2	6	49379	49384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_009004	TAA	2	6	52941	52946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_009004	ATG	2	6	55242	55247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_009004	TATAA	2	10	55279	55288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009004	TAAA	2	8	55294	55301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_009004	T	7	7	55794	55800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_009004	TTA	2	6	55803	55808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009004	AAT	2	6	55873	55878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009004	TTTAA	2	10	56467	56476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009004	TTA	2	6	56530	56535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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